あまり詳しくないのですが、ALT+TAB等のシステムキー関連は割とOSの根底の部分で
キー入力を横取りしてシステムキーだったら押されていなかったことにする、等の処理を
加える必要があるためか、アンチウイルス系のファイアウォールに「不正な処理をするプログラム」として
引っかかってしまうようです。
私の環境ではファイアウォールが横取りを遮っているために SetSysCommandOffFlag が無効に
なってしまっていたのですが、正常に動作しない全ての環境でそれが原因なのかはわかっていません。
他に何か良い方法があれば実装したいとは思うのですが・・・