こんにちは。
SetWindowSizeExtendRateを利用すれば実現できると思われます。
＜リファレンスページ＞
ttp://homepage2.nifty.com/natupaji/DxLib/dxfunc.html#R11N4
実際のサイズが640×480にセットされていたら
SetWindowSizeExtendRate( 0.5 );
で320×240サイズ、
SetWindowSizeExtendRate( 2.0 );
で1280×960
になります。
SetWindowSizeExtendRateはDxLib_Init()前に呼ぶ必要があるようです。